Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CENPPQ6IPU0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPPQ6IPU0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms