Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG9BQ674R7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG9BQ674R7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms