Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf135Q5VTT2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf135Q5VTT2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms