Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP9Q5VTM2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP9Q5VTM2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms