Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
LGSNQ5TDP6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LGSNQ5TDP6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LGSNQ5TDP6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGSNQ5TDP6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms