Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL8

PRAMEF19, PRAME family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF19Q5SWL8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF19Q5SWL8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF19Q5SWL8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF19Q5SWL8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF19Q5SWL8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF19Q5SWL8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF19Q5SWL8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF19Q5SWL8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF19Q5SWL8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF19Q5SWL8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF19Q5SWL8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAMEF19Q5SWL8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAMEF19Q5SWL8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF19Q5SWL8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF19Q5SWL8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF19Q5SWL8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms