Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPANXN4Q5MJ08 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPANXN4Q5MJ08 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPANXN4Q5MJ08 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms