Protein–RNA interactions for Protein: Q53EP0

FNDC3B, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3BQ53EP0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC3BQ53EP0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC3BQ53EP0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms