Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM259Q4ZIN3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM259Q4ZIN3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM259Q4ZIN3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms