Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IMPG1Q17R60 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IMPG1Q17R60 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IMPG1Q17R60 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 314.6 ms