Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTGISQ16647 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGISQ16647 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGISQ16647 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGISQ16647 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGISQ16647 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTGISQ16647 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTGISQ16647 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTGISQ16647 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTGISQ16647 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTGISQ16647 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTGISQ16647 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTGISQ16647 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTGISQ16647 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTGISQ16647 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PTGISQ16647 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTGISQ16647 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTGISQ16647 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PTGISQ16647 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTGISQ16647 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTGISQ16647 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTGISQ16647 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTGISQ16647 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTGISQ16647 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTGISQ16647 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTGISQ16647 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTGISQ16647 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTGISQ16647 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PTGISQ16647 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PTGISQ16647 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTGISQ16647 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTGISQ16647 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTGISQ16647 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTGISQ16647 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGISQ16647 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms