Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNCBQ16143 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNCBQ16143 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNCBQ16143 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
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