Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SEPT9-213ENST00000586433 569 ntTSL 413.61□□□□□ -0.234e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SEPT9-238ENST00000591472 555 ntTSL 413.23□□□□□ -0.294e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-220ENST00000514830 802 ntTSL 213.23□□□□□ -0.295e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.325e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-213ENST00000482570 582 ntTSL 212.79□□□□□ -0.365e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 MEMO1-201ENST00000295065 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.385e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SEPT9-235ENST00000591020 582 ntTSL 412.27□□□□□ -0.454e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-206ENST00000437932 5713 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.555e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 511.48□□□□□ -0.575e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SEPT9-234ENST00000590938 611 ntTSL 411.36□□□□□ -0.594e-15■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-210ENST00000508216 1794 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.685e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-236ENST00000521981 552 ntTSL 510.54□□□□□ -0.725e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-230ENST00000521250 592 ntTSL 410.5□□□□□ -0.735e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-223ENST00000627587 1853 ntTSL 210.21□□□□□ -0.785e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-207ENST00000503974 2081 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.825e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 39.91□□□□□ -0.825e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-213ENST00000509357 554 ntTSL 59.65□□□□□ -0.865e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 MEMO1-203ENST00000404530 1482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.895e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 AL020996.2-202ENST00000527604 334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.895e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-201ENST00000317968 6083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.935e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 SELENON-205ENST00000630065 2994 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.955e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-222ENST00000615540 6219 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.965e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-238ENST00000521986 2393 ntTSL 28.46□□□□□ -1.065e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.15e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-227ENST00000521029 584 ntTSL 48.17□□□□□ -1.15e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-255ENST00000524202 3014 ntTSL 1 (best)8.05□□□□□ -1.125e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.185e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-246ENST00000523539 3236 ntTSL 27.5□□□□□ -1.215e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.225e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.265e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.285e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.295e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-217ENST00000519899 762 ntTSL 26.8□□□□□ -1.325e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-211ENST00000519361 553 ntTSL 56.8□□□□□ -1.325e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-250ENST00000523746 574 ntTSL 46.67□□□□□ -1.345e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-247ENST00000523670 542 ntTSL 46.15□□□□□ -1.425e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-215ENST00000519654 4129 ntTSL 1 (best)6.1□□□□□ -1.435e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.445e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.495e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.57e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-211ENST00000508531 480 ntTSL 45.49□□□□□ -1.535e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 DPY30-206ENST00000446765 1519 ntTSL 55.15□□□□□ -1.585e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.65e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-214ENST00000510099 554 ntTSL 45.05□□□□□ -1.65e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-210ENST00000519024 576 ntTSL 44.73□□□□□ -1.655e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PDLIM5-218ENST00000513341 794 ntTSL 34.05□□□□□ -1.765e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 PTK2-245ENST00000523474 567 ntTSL 52.72□□□□□ -1.975e-8■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.872e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.982e-9■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 28.25□□□□□ -1.093e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.093e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBAP2-206ENST00000412543 1349 ntTSL 57.83□□□□□ -1.163e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.163e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 UBAP2-207ENST00000421278 833 ntTSL 56.95□□□□□ -1.33e-10■■■■■ 41.6
PCBP1Q15365 VARS-217ENST00000440048 804 ntTSL 1 (best)26.2■■□□□ 1.782e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.58e-7■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 FTCD-210ENST00000488577 447 ntTSL 321.65■■□□□ 1.064e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.015e-8■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.988e-7■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 MLF2-208ENST00000541305 564 ntTSL 220.46■□□□□ 0.878e-7■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 MLF2-205ENST00000537126 851 ntTSL 518.55■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 FADS1-215ENST00000541683 1844 ntTSL 218.37■□□□□ 0.534e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 TRIM28-205ENST00000595028 486 ntTSL 216.77■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 COL4A5-203ENST00000470339 782 ntTSL 316.54■□□□□ 0.244e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.155e-8■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 TNS3-210ENST00000469470 584 ntTSL 314.63□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 41.5
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PCBP1Q15365 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 TNS3-207ENST00000450444 1832 ntTSL 514.04□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.24e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RAP2C-203ENST00000460462 804 ntTSL 313.76□□□□□ -0.215e-8■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.324e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 COL4A5-202ENST00000361603 6469 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 COL4A5-201ENST00000328300 6483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RNF43-203ENST00000577716 4367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.654e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 TNS3-208ENST00000457718 3836 ntTSL 510.75□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RNF43-207ENST00000583753 3560 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.764e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.84e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 TNS3-212ENST00000485555 357 ntTSL 39.58□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RAP2C-205ENST00000620646 3341 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.945e-8■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.154e-13■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.364e-13■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 NCSTN-212ENST00000469159 856 ntTSL 28.86□□□□□ -0.994e-13■■■■■ 41.5
PCBP1Q15365 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.652e-35■■■■■ 41.4
PCBP1Q15365 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.272e-35■■■■■ 41.4
PCBP1Q15365 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.112e-35■■■■■ 41.4
PCBP1Q15365 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-35■■■■■ 41.4
PCBP1Q15365 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.396e-7■■■■■ 41.3
PCBP1Q15365 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 41.3
PCBP1Q15365 SLC35A4-202ENST00000514199 3617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 41.3
PCBP1Q15365 C9orf16-202ENST00000486420 434 ntTSL 513.84□□□□□ -0.193e-9■■■■■ 41.2
PCBP1Q15365 ARHGEF1-223ENST00000617585 737 ntTSL 224.93■■□□□ 1.581e-6■■■■■ 41.2
PCBP1Q15365 AC005307.1-201ENST00000567877 1570 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.733e-13■■■■■ 41.1
PCBP1Q15365 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 41.1
PCBP1Q15365 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.574e-8■■■■■ 41
PCBP1Q15365 DPM2-205ENST00000495270 1662 ntTSL 1 (best)17.8■□□□□ 0.444e-8■■■■■ 41
PCBP1Q15365 DPM2-203ENST00000470181 928 ntTSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 41
PCBP1Q15365 DPM2-204ENST00000473360 744 ntTSL 514.36□□□□□ -0.114e-8■■■■■ 41
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