RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617585.1

ARHGEF1-223, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARHGEF1, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF1-223ENST00000617585 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.48■■■■■ 6.47
ARHGEF1-223ENST00000617585 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.63■■■■■ 5.53
ARHGEF1-223ENST00000617585 ABCC9O60706 1549 aa48.9■■■■■ 5.42
ARHGEF1-223ENST00000617585 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.91■■■■■ 5.1
ARHGEF1-223ENST00000617585 NACADO15069 1562 aa46.76■■■■■ 5.08
ARHGEF1-223ENST00000617585 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.39■■■■■ 5.02
ARHGEF1-223ENST00000617585 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.33■■■■■ 5.01
ARHGEF1-223ENST00000617585 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.11■■■■■ 4.97
ARHGEF1-223ENST00000617585 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.97■■■■■ 4.95
ARHGEF1-223ENST00000617585 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.91■■■■■ 4.94
ARHGEF1-223ENST00000617585 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.56■■■■■ 4.882e-6■■□□□ 12.9
ARHGEF1-223ENST00000617585 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.55■■■■■ 4.88
ARHGEF1-223ENST00000617585 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.43■■■■■ 4.86
ARHGEF1-223ENST00000617585 SCRIBQ14160 1630 aa45.08■■■■■ 4.81
ARHGEF1-223ENST00000617585 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.07■■■■■ 4.81
ARHGEF1-223ENST00000617585 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
ARHGEF1-223ENST00000617585 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.3■■■■■ 4.68
ARHGEF1-223ENST00000617585 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.04■■■■■ 4.64
ARHGEF1-223ENST00000617585 SMARCA4P51532 1647 aa43.16■■■■■ 4.5
ARHGEF1-223ENST00000617585 NCAPD3P42695 1498 aa43.16■■■■■ 4.5
ARHGEF1-223ENST00000617585 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.06■■■■■ 4.48
ARHGEF1-223ENST00000617585 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
ARHGEF1-223ENST00000617585 SMARCA2P51531 1590 aa42.99■■■■■ 4.47
ARHGEF1-223ENST00000617585 HMGXB3Q12766 1538 aa42.89■■■■■ 4.46
ARHGEF1-223ENST00000617585 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.83■■■■■ 4.45
ARHGEF1-223ENST00000617585 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.71■■■■■ 4.43
ARHGEF1-223ENST00000617585 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
ARHGEF1-223ENST00000617585 WIZO95785 1651 aa42.22■■■■■ 4.35
ARHGEF1-223ENST00000617585 NESP48681 1621 aa42.19■■■■■ 4.34
ARHGEF1-223ENST00000617585 ERCC6Q03468 1493 aa42.17■■■■■ 4.34
ARHGEF1-223ENST00000617585 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.1■■■■■ 4.33
ARHGEF1-223ENST00000617585 CUX2O14529 1486 aa42.04■■■■■ 4.32
ARHGEF1-223ENST00000617585 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
ARHGEF1-223ENST00000617585 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.82■■■■■ 4.29
ARHGEF1-223ENST00000617585 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.78■■■■■ 4.28
ARHGEF1-223ENST00000617585 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
ARHGEF1-223ENST00000617585 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
ARHGEF1-223ENST00000617585 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.73■■■■■ 4.27
ARHGEF1-223ENST00000617585 CFTRP13569 1480 aa41.48■■■■■ 4.23
ARHGEF1-223ENST00000617585 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.37■■■■■ 4.21
ARHGEF1-223ENST00000617585 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.37■■■■■ 4.21
ARHGEF1-223ENST00000617585 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.31■■■■■ 4.2
ARHGEF1-223ENST00000617585 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.31■■■■■ 4.2
ARHGEF1-223ENST00000617585 WDR62O43379 1518 aa41.3■■■■■ 4.2
ARHGEF1-223ENST00000617585 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.26■■■■■ 4.2
ARHGEF1-223ENST00000617585 PRDM2Q13029 1718 aa41.2■■■■■ 4.19
ARHGEF1-223ENST00000617585 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
ARHGEF1-223ENST00000617585 ABCC8Q09428 1581 aa40.62■■■■■ 4.09
ARHGEF1-223ENST00000617585 TOPBP1Q92547 1522 aa40.61■■■■■ 4.09
ARHGEF1-223ENST00000617585 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.53■■■■■ 4.08
ARHGEF1-223ENST00000617585 IFT140Q96RY7 1462 aa40.49■■■■■ 4.07
ARHGEF1-223ENST00000617585 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
ARHGEF1-223ENST00000617585 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
ARHGEF1-223ENST00000617585 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
ARHGEF1-223ENST00000617585 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
ARHGEF1-223ENST00000617585 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
ARHGEF1-223ENST00000617585 OSCARQ8IYS5 282 aa40.14■■■■■ 4.02
ARHGEF1-223ENST00000617585 CUX1P39880 1505 aa40.11■■■■■ 4.01
ARHGEF1-223ENST00000617585 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.03■■■■■ 4
ARHGEF1-223ENST00000617585 SOGA1O94964 1423 aa40.03■■■■■ 4
ARHGEF1-223ENST00000617585 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.01■■■■■ 44e-6■■■■■ 27.8
ARHGEF1-223ENST00000617585 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.01■■■■■ 4
ARHGEF1-223ENST00000617585 WDR97A6NE52 1622 aa39.96■■■■□ 3.99
ARHGEF1-223ENST00000617585 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
ARHGEF1-223ENST00000617585 CHD1O14646 1710 aa39.78■■■■□ 3.96
ARHGEF1-223ENST00000617585 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.68■■■■□ 3.94
ARHGEF1-223ENST00000617585 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.67■■■■□ 3.94
ARHGEF1-223ENST00000617585 TOP2BQ02880 1626 aa39.65■■■■□ 3.94
ARHGEF1-223ENST00000617585 GRIN2BQ13224 1484 aa39.64■■■■□ 3.94
ARHGEF1-223ENST00000617585 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.63■■■■□ 3.94
ARHGEF1-223ENST00000617585 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
ARHGEF1-223ENST00000617585 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.62■■■■□ 3.93
ARHGEF1-223ENST00000617585 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.6■■■■□ 3.93
ARHGEF1-223ENST00000617585 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.6■■■■□ 3.93
ARHGEF1-223ENST00000617585 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.6■■■■□ 3.93
ARHGEF1-223ENST00000617585 TRIM41Q8WV44 630 aa39.59■■■■□ 3.93
ARHGEF1-223ENST00000617585 SYNJ1O43426 1573 aa39.57■■■■□ 3.92
ARHGEF1-223ENST00000617585 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.57■■■■□ 3.92
ARHGEF1-223ENST00000617585 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.56■■■■□ 3.92
ARHGEF1-223ENST00000617585 PBRM1Q86U86 1689 aa39.56■■■■□ 3.92
ARHGEF1-223ENST00000617585 ARHGEF11O15085 1522 aa39.52■■■■□ 3.92
ARHGEF1-223ENST00000617585 FBLN2P98095 1184 aa39.52■■■■□ 3.92
ARHGEF1-223ENST00000617585 SYNJ2O15056 1496 aa39.46■■■■□ 3.91
ARHGEF1-223ENST00000617585 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
ARHGEF1-223ENST00000617585 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.37■■■■□ 3.89
ARHGEF1-223ENST00000617585 ADAMTS12P58397 1594 aa39.2■■■■□ 3.87
ARHGEF1-223ENST00000617585 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.19■■■■□ 3.86
ARHGEF1-223ENST00000617585 ARAP1Q96P48 1450 aa39.17■■■■□ 3.86
ARHGEF1-223ENST00000617585 GRIN2AQ12879 1464 aa39.14■■■■□ 3.86
ARHGEF1-223ENST00000617585 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.11■■■■□ 3.85
ARHGEF1-223ENST00000617585 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.1■■■■□ 3.85
ARHGEF1-223ENST00000617585 NUP160Q12769 1436 aa39.03■■■■□ 3.84
ARHGEF1-223ENST00000617585 CEP170Q5SW79 1584 aa38.97■■■■□ 3.83
ARHGEF1-223ENST00000617585 KIF27Q86VH2 1401 aa38.83■■■■□ 3.81
ARHGEF1-223ENST00000617585 SHROOM2Q13796 1616 aa38.83■■■■□ 3.81
ARHGEF1-223ENST00000617585 IGF1RP08069 1367 aa38.78■■■■□ 3.8
ARHGEF1-223ENST00000617585 CUL7Q14999 1698 aa38.73■■■■□ 3.79
ARHGEF1-223ENST00000617585 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.72■■■■□ 3.79
ARHGEF1-223ENST00000617585 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.63■■■■□ 3.78
ARHGEF1-223ENST00000617585 JPH4Q96JJ6 628 aa38.56■■■■□ 3.76
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