Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.722e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.712e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.72e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ITSN1-224ENST00000470742 474 ntTSL 419.38■□□□□ 0.692e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.662e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.612e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ENGASE-208ENST00000583646 471 ntTSL 218.78■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 SLC19A1-210ENST00000486303 708 ntTSL 218.73■□□□□ 0.592e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MSH5-215ENST00000482280 944 ntTSL 218.69■□□□□ 0.585e-9■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MSH5-210ENST00000463094 796 ntTSL 218.69■□□□□ 0.585e-9■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ENGASE-202ENST00000311595 1381 ntTSL 518.68■□□□□ 0.582e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-205ENST00000536872 871 ntTSL 518.64■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PSMC3-203ENST00000526993 580 ntTSL 218.51■□□□□ 0.552e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 DGKZ-210ENST00000525434 582 ntTSL 518.36■□□□□ 0.532e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ZNF689-205ENST00000565710 602 ntTSL 217.98■□□□□ 0.472e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MPZ-205ENST00000526189 957 ntTSL 317.91■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MAN1B1-208ENST00000536268 554 ntTSL 217.81■□□□□ 0.447e-16■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 CCNE1-205ENST00000575243 820 ntTSL 517.8■□□□□ 0.443e-10■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 FLOT2-207ENST00000581509 426 ntTSL 217.79■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NOL12-205ENST00000484650 813 ntTSL 217.78■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-216ENST00000543170 552 ntTSL 217.75■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 FTSJ1-211ENST00000490202 965 ntTSL 517.63■□□□□ 0.415e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ITSN1-219ENST00000444491 827 ntTSL 417.54■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MSH5-207ENST00000425703 694 ntTSL 517.5■□□□□ 0.395e-9■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.392e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MPZ-202ENST00000476410 878 ntTSL 317.43■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NPDC1-205ENST00000488145 701 ntTSL 217.4■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 SLC23A1-206ENST00000506512 560 ntTSL 417.35■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-202ENST00000455113 1718 ntTSL 317.28■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NDUFS8-213ENST00000531282 536 ntTSL 217.28■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PTPRU-206ENST00000465525 1650 ntTSL 217.23■□□□□ 0.352e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PPFIA1-218ENST00000530932 536 ntTSL 517.11■□□□□ 0.332e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 SLC19A1-204ENST00000427839 648 ntTSL 317.07■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MYL5-202ENST00000502720 551 ntTSL 417.05■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 EDC4-205ENST00000572724 516 ntTSL 417.02■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 DGKZ-223ENST00000534215 568 ntTSL 417.02■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PSMC3-208ENST00000530887 891 ntTSL 216.99■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PTPRU-207ENST00000492954 625 ntTSL 216.97■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 FAM117A-210ENST00000514018 1128 ntTSL 516.87■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MAN2A2-228ENST00000561047 1057 ntTSL 516.86■□□□□ 0.293e-9■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 AP5Z1-205ENST00000490487 917 ntTSL 316.74■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NPC2-206ENST00000555592 469 ntTSL 516.64■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MAN1B1-216ENST00000550113 774 ntTSL 316.6■□□□□ 0.257e-16■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NPC2-208ENST00000556009 699 ntTSL 516.46■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TRMT1-218ENST00000592606 592 ntTSL 216.37■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 BOLA3-203ENST00000469676 1436 ntTSL 516.36■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NPDC1-204ENST00000485589 506 ntTSL 216.34■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MPZ-203ENST00000488271 366 ntTSL 216.18■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ATAD3A-205ENST00000429957 498 ntTSL 516■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ACTN1-209ENST00000553659 434 ntTSL 415.93■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.112e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MAN2A2-213ENST00000559374 851 ntTSL 515.69■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MPZ-201ENST00000463290 1693 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 IQSEC1-202ENST00000473088 545 ntTSL 415.66■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ANKRD27-207ENST00000590519 1067 ntTSL 515.52■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PTPRU-208ENST00000493601 695 ntTSL 515.48■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 RAB11FIP3-209ENST00000483002 585 ntTSL 415.41■□□□□ 0.062e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 CNOT7-210ENST00000523649 699 ntTSL 215.41■□□□□ 0.062e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MLST8-209ENST00000562479 581 ntTSL 315.4■□□□□ 0.062e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 POMT2-215ENST00000556394 693 ntTSL 315.34■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MAST1-204ENST00000589040 983 ntTSL 515.33■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NOL12-202ENST00000438329 945 ntTSL 1 (best)15.29■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 CHTF18-215ENST00000564940 197 ntTSL 215.26■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PPP1R13B-214ENST00000556597 3473 ntTSL 215.26■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 FAM117A-205ENST00000505159 739 ntTSL 315.25■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ICAM1-204ENST00000588645 581 ntTSL 215.16■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 SLC19A1-205ENST00000443742 777 ntTSL 315.09■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 02e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MAN1B1-204ENST00000475449 905 ntTSL 314.99□□□□□ -0.017e-16■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MRTO4-202ENST00000479559 409 ntTSL 214.85□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PSMC3-202ENST00000524447 935 ntTSL 314.75□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TOMM40L-204ENST00000468803 424 ntTSL 214.56□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NOL12-203ENST00000468597 632 ntTSL 214.48□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 UPF1-202ENST00000594243 683 ntTSL 314.44□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 214.44□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 POMT2-223ENST00000602717 658 ntTSL 514.39□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 FBRS-206ENST00000494101 2782 ntTSL 214.24□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 57.6
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