RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.53■■■■■ 4.72
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.71■■■■□ 3.95
PTPRU-207ENST00000492954 ABCC9O60706 1549 aa39.39■■■■□ 3.9
PTPRU-207ENST00000492954 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.63■■■■□ 3.61
PTPRU-207ENST00000492954 NACADO15069 1562 aa37.47■■■■□ 3.59
PTPRU-207ENST00000492954 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.44■■■■□ 3.58
PTPRU-207ENST00000492954 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.09■■■■□ 3.53
PTPRU-207ENST00000492954 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
PTPRU-207ENST00000492954 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.78■■■■□ 3.48
PTPRU-207ENST00000492954 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.76■■■■□ 3.48
PTPRU-207ENST00000492954 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.73■■■■□ 3.47
PTPRU-207ENST00000492954 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.59■■■■□ 3.45
PTPRU-207ENST00000492954 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.53■■■■□ 3.44
PTPRU-207ENST00000492954 SCRIBQ14160 1630 aa36.28■■■■□ 3.4
PTPRU-207ENST00000492954 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.06■■■■□ 3.36
PTPRU-207ENST00000492954 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
PTPRU-207ENST00000492954 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.57■■■■□ 3.28
PTPRU-207ENST00000492954 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.42■■■■□ 3.26
PTPRU-207ENST00000492954 SMARCA4P51532 1647 aa34.63■■■■□ 3.13
PTPRU-207ENST00000492954 NCAPD3P42695 1498 aa34.61■■■■□ 3.13
PTPRU-207ENST00000492954 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.58■■■■□ 3.13
PTPRU-207ENST00000492954 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
PTPRU-207ENST00000492954 SMARCA2P51531 1590 aa34.49■■■■□ 3.11
PTPRU-207ENST00000492954 HMGXB3Q12766 1538 aa34.38■■■■□ 3.09
PTPRU-207ENST00000492954 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.33■■■■□ 3.09
PTPRU-207ENST00000492954 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.28■■■■□ 3.08
PTPRU-207ENST00000492954 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
PTPRU-207ENST00000492954 ERCC6Q03468 1493 aa33.96■■■■□ 3.03
PTPRU-207ENST00000492954 NESP48681 1621 aa33.96■■■■□ 3.03
PTPRU-207ENST00000492954 WIZO95785 1651 aa33.92■■■■□ 3.02
PTPRU-207ENST00000492954 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
PTPRU-207ENST00000492954 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.74■■■□□ 2.99
PTPRU-207ENST00000492954 CUX2O14529 1486 aa33.74■■■□□ 2.99
PTPRU-207ENST00000492954 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.6■■■□□ 2.97
PTPRU-207ENST00000492954 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.55■■■□□ 2.96
PTPRU-207ENST00000492954 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
PTPRU-207ENST00000492954 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
PTPRU-207ENST00000492954 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.48■■■□□ 2.95
PTPRU-207ENST00000492954 CFTRP13569 1480 aa33.3■■■□□ 2.92
PTPRU-207ENST00000492954 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.25■■■□□ 2.91
PTPRU-207ENST00000492954 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.24■■■□□ 2.91
PTPRU-207ENST00000492954 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.22■■■□□ 2.91
PTPRU-207ENST00000492954 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.21■■■□□ 2.91
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.17■■■□□ 2.9
PTPRU-207ENST00000492954 WDR62O43379 1518 aa33.14■■■□□ 2.9
PTPRU-207ENST00000492954 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
PTPRU-207ENST00000492954 PRDM2Q13029 1718 aa32.91■■■□□ 2.86
PTPRU-207ENST00000492954 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
PTPRU-207ENST00000492954 TOPBP1Q92547 1522 aa32.64■■■□□ 2.82
PTPRU-207ENST00000492954 ABCC8Q09428 1581 aa32.55■■■□□ 2.8
PTPRU-207ENST00000492954 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.53■■■□□ 2.8
PTPRU-207ENST00000492954 IFT140Q96RY7 1462 aa32.52■■■□□ 2.8
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
PTPRU-207ENST00000492954 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
PTPRU-207ENST00000492954 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
PTPRU-207ENST00000492954 OSCARQ8IYS5 282 aa32.27■■■□□ 2.76
PTPRU-207ENST00000492954 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
PTPRU-207ENST00000492954 CUX1P39880 1505 aa32.24■■■□□ 2.75
PTPRU-207ENST00000492954 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.22■■■□□ 2.756e-7■■■■■ 27.8
PTPRU-207ENST00000492954 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.22■■■□□ 2.75
PTPRU-207ENST00000492954 SOGA1O94964 1423 aa32.19■■■□□ 2.74
PTPRU-207ENST00000492954 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.19■■■□□ 2.74
PTPRU-207ENST00000492954 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
PTPRU-207ENST00000492954 TRIM41Q8WV44 630 aa32.01■■■□□ 2.71
PTPRU-207ENST00000492954 WDR97A6NE52 1622 aa31.96■■■□□ 2.71
PTPRU-207ENST00000492954 FBLN2P98095 1184 aa31.92■■■□□ 2.7
PTPRU-207ENST00000492954 CHD1O14646 1710 aa31.91■■■□□ 2.7
PTPRU-207ENST00000492954 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.9■■■□□ 2.7
PTPRU-207ENST00000492954 GRIN2BQ13224 1484 aa31.85■■■□□ 2.69
PTPRU-207ENST00000492954 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.85■■■□□ 2.69
PTPRU-207ENST00000492954 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.85■■■□□ 2.69
PTPRU-207ENST00000492954 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.8■■■□□ 2.68
PTPRU-207ENST00000492954 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
PTPRU-207ENST00000492954 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.8■■■□□ 2.68
PTPRU-207ENST00000492954 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.8■■■□□ 2.68
PTPRU-207ENST00000492954 TOP2BQ02880 1626 aa31.8■■■□□ 2.68
PTPRU-207ENST00000492954 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.8■■■□□ 2.68
PTPRU-207ENST00000492954 SYNJ1O43426 1573 aa31.8■■■□□ 2.68
PTPRU-207ENST00000492954 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.79■■■□□ 2.68
PTPRU-207ENST00000492954 ARHGEF11O15085 1522 aa31.76■■■□□ 2.68
PTPRU-207ENST00000492954 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.75■■■□□ 2.67
PTPRU-207ENST00000492954 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
PTPRU-207ENST00000492954 PBRM1Q86U86 1689 aa31.72■■■□□ 2.67
PTPRU-207ENST00000492954 SYNJ2O15056 1496 aa31.7■■■□□ 2.66
PTPRU-207ENST00000492954 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.59■■■□□ 2.65
PTPRU-207ENST00000492954 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.52■■■□□ 2.64
PTPRU-207ENST00000492954 ARAP1Q96P48 1450 aa31.5■■■□□ 2.63
PTPRU-207ENST00000492954 ADAMTS12P58397 1594 aa31.48■■■□□ 2.63
PTPRU-207ENST00000492954 GRIN2AQ12879 1464 aa31.46■■■□□ 2.63
PTPRU-207ENST00000492954 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.44■■■□□ 2.62
PTPRU-207ENST00000492954 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.42■■■□□ 2.62
PTPRU-207ENST00000492954 NUP160Q12769 1436 aa31.33■■■□□ 2.61
PTPRU-207ENST00000492954 CEP170Q5SW79 1584 aa31.32■■■□□ 2.6
PTPRU-207ENST00000492954 KIF27Q86VH2 1401 aa31.22■■■□□ 2.59
PTPRU-207ENST00000492954 IGF1RP08069 1367 aa31.17■■■□□ 2.58
PTPRU-207ENST00000492954 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.16■■■□□ 2.58
PTPRU-207ENST00000492954 SHROOM2Q13796 1616 aa31.11■■■□□ 2.57
PTPRU-207ENST00000492954 CUL7Q14999 1698 aa31.03■■■□□ 2.56
PTPRU-207ENST00000492954 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.03■■■□□ 2.56
PTPRU-207ENST00000492954 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
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