RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.65■■■■■ 4.74
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.75■■■■□ 3.95
COPS7A-216ENST00000543170 ABCC9O60706 1549 aa38.57■■■■□ 3.76
COPS7A-216ENST00000543170 NACADO15069 1562 aa37.29■■■■□ 3.56
COPS7A-216ENST00000543170 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.28■■■■□ 3.56
COPS7A-216ENST00000543170 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
COPS7A-216ENST00000543170 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.18■■■■□ 3.54
COPS7A-216ENST00000543170 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.05■■■■□ 3.52
COPS7A-216ENST00000543170 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.99■■■■□ 3.51
COPS7A-216ENST00000543170 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.45■■■■□ 3.43
COPS7A-216ENST00000543170 SCRIBQ14160 1630 aa36.14■■■■□ 3.38
COPS7A-216ENST00000543170 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.13■■■■□ 3.37
COPS7A-216ENST00000543170 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.97■■■■□ 3.35
COPS7A-216ENST00000543170 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.89■■■■□ 3.34
COPS7A-216ENST00000543170 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.2■■■■□ 3.23
COPS7A-216ENST00000543170 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
COPS7A-216ENST00000543170 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.97■■■■□ 3.19
COPS7A-216ENST00000543170 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.7■■■■□ 3.15
COPS7A-216ENST00000543170 SMARCA4P51532 1647 aa34.64■■■■□ 3.14
COPS7A-216ENST00000543170 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
COPS7A-216ENST00000543170 SMARCA2P51531 1590 aa34.4■■■■□ 3.1
COPS7A-216ENST00000543170 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.39■■■■□ 3.1
COPS7A-216ENST00000543170 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.37■■■■□ 3.09
COPS7A-216ENST00000543170 NCAPD3P42695 1498 aa34.37■■■■□ 3.09
COPS7A-216ENST00000543170 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.36■■■■□ 3.09
COPS7A-216ENST00000543170 HMGXB3Q12766 1538 aa34.28■■■■□ 3.08
COPS7A-216ENST00000543170 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
COPS7A-216ENST00000543170 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
COPS7A-216ENST00000543170 WIZO95785 1651 aa34.02■■■■□ 3.04
COPS7A-216ENST00000543170 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
COPS7A-216ENST00000543170 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.48■■■□□ 2.95
COPS7A-216ENST00000543170 NESP48681 1621 aa33.42■■■□□ 2.94
COPS7A-216ENST00000543170 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.34■■■□□ 2.93
COPS7A-216ENST00000543170 ERCC6Q03468 1493 aa33.26■■■□□ 2.92
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.25■■■□□ 2.91
COPS7A-216ENST00000543170 CFTRP13569 1480 aa33.2■■■□□ 2.91
COPS7A-216ENST00000543170 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.19■■■□□ 2.9
COPS7A-216ENST00000543170 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.1■■■□□ 2.89
COPS7A-216ENST00000543170 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
COPS7A-216ENST00000543170 PRDM2Q13029 1718 aa33.07■■■□□ 2.88
COPS7A-216ENST00000543170 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
COPS7A-216ENST00000543170 CUX2O14529 1486 aa32.96■■■□□ 2.87
COPS7A-216ENST00000543170 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.96■■■□□ 2.87
COPS7A-216ENST00000543170 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.93■■■□□ 2.86
COPS7A-216ENST00000543170 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.86■■■□□ 2.85
COPS7A-216ENST00000543170 WDR62O43379 1518 aa32.79■■■□□ 2.84
COPS7A-216ENST00000543170 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
COPS7A-216ENST00000543170 ABCC8Q09428 1581 aa32.51■■■□□ 2.79
COPS7A-216ENST00000543170 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.47■■■□□ 2.79
COPS7A-216ENST00000543170 TOPBP1Q92547 1522 aa32.46■■■□□ 2.79
COPS7A-216ENST00000543170 CUX1P39880 1505 aa32.26■■■□□ 2.75
COPS7A-216ENST00000543170 IFT140Q96RY7 1462 aa32.24■■■□□ 2.75
COPS7A-216ENST00000543170 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
COPS7A-216ENST00000543170 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
COPS7A-216ENST00000543170 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.12■■■□□ 2.73
COPS7A-216ENST00000543170 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.09■■■□□ 2.73
COPS7A-216ENST00000543170 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.08■■■□□ 2.73
COPS7A-216ENST00000543170 TOP2BQ02880 1626 aa32.07■■■□□ 2.72
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
COPS7A-216ENST00000543170 SYNJ1O43426 1573 aa32.02■■■□□ 2.72
COPS7A-216ENST00000543170 SOGA1O94964 1423 aa32■■■□□ 2.71
COPS7A-216ENST00000543170 WDR97A6NE52 1622 aa31.99■■■□□ 2.71
COPS7A-216ENST00000543170 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
COPS7A-216ENST00000543170 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.98■■■□□ 2.71
COPS7A-216ENST00000543170 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.86■■■□□ 2.69
COPS7A-216ENST00000543170 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.83■■■□□ 2.69
COPS7A-216ENST00000543170 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
COPS7A-216ENST00000543170 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.75■■■□□ 2.67
COPS7A-216ENST00000543170 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.68■■■□□ 2.66
COPS7A-216ENST00000543170 PBRM1Q86U86 1689 aa31.67■■■□□ 2.66
COPS7A-216ENST00000543170 GRIN2BQ13224 1484 aa31.67■■■□□ 2.66
COPS7A-216ENST00000543170 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.65■■■□□ 2.66
COPS7A-216ENST00000543170 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
COPS7A-216ENST00000543170 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.6■■■□□ 2.65
COPS7A-216ENST00000543170 CHD1O14646 1710 aa31.54■■■□□ 2.64
COPS7A-216ENST00000543170 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.5■■■□□ 2.63
COPS7A-216ENST00000543170 OSCARQ8IYS5 282 aa31.47■■■□□ 2.63
COPS7A-216ENST00000543170 SYNJ2O15056 1496 aa31.46■■■□□ 2.63
COPS7A-216ENST00000543170 ADAMTS12P58397 1594 aa31.43■■■□□ 2.62
COPS7A-216ENST00000543170 KIF27Q86VH2 1401 aa31.41■■■□□ 2.62
COPS7A-216ENST00000543170 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.33■■■□□ 2.61
COPS7A-216ENST00000543170 FBLN2P98095 1184 aa31.33■■■□□ 2.61
COPS7A-216ENST00000543170 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
COPS7A-216ENST00000543170 TRIM41Q8WV44 630 aa31.3■■■□□ 2.6
COPS7A-216ENST00000543170 GRIN2AQ12879 1464 aa31.27■■■□□ 2.6
COPS7A-216ENST00000543170 CUL7Q14999 1698 aa31.26■■■□□ 2.6
COPS7A-216ENST00000543170 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.23■■■□□ 2.59
COPS7A-216ENST00000543170 IGF1RP08069 1367 aa31.22■■■□□ 2.59
COPS7A-216ENST00000543170 NUP160Q12769 1436 aa31.15■■■□□ 2.58
COPS7A-216ENST00000543170 CEP170Q5SW79 1584 aa31.12■■■□□ 2.57
COPS7A-216ENST00000543170 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.08■■■□□ 2.57
COPS7A-216ENST00000543170 ARHGEF11O15085 1522 aa31.06■■■□□ 2.56
COPS7A-216ENST00000543170 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.05■■■□□ 2.56
COPS7A-216ENST00000543170 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.05■■■□□ 2.56
COPS7A-216ENST00000543170 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.05■■■□□ 2.56
COPS7A-216ENST00000543170 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.05■■■□□ 2.56
COPS7A-216ENST00000543170 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.01■■■□□ 2.55
COPS7A-216ENST00000543170 EEA1Q15075 1411 aa30.95■■■□□ 2.54
COPS7A-216ENST00000543170 SHROOM2Q13796 1616 aa30.94■■■□□ 2.54
COPS7A-216ENST00000543170 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms