RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465525.6

PTPRU-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 1,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-206ENST00000465525 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.28■■■■■ 4.04
PTPRU-206ENST00000465525 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.49■■■■□ 3.27
PTPRU-206ENST00000465525 ABCC9O60706 1549 aa34.23■■■■□ 3.07
PTPRU-206ENST00000465525 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
PTPRU-206ENST00000465525 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.5■■■□□ 2.95
PTPRU-206ENST00000465525 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.33■■■□□ 2.93
PTPRU-206ENST00000465525 NACADO15069 1562 aa33.28■■■□□ 2.92
PTPRU-206ENST00000465525 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.27■■■□□ 2.92
PTPRU-206ENST00000465525 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.17■■■□□ 2.9
PTPRU-206ENST00000465525 SCRIBQ14160 1630 aa32.56■■■□□ 2.8
PTPRU-206ENST00000465525 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.53■■■□□ 2.8
PTPRU-206ENST00000465525 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.41■■■□□ 2.78
PTPRU-206ENST00000465525 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.12■■■□□ 2.73
PTPRU-206ENST00000465525 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.12■■■□□ 2.73
PTPRU-206ENST00000465525 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.39■■■□□ 2.61
PTPRU-206ENST00000465525 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
PTPRU-206ENST00000465525 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
PTPRU-206ENST00000465525 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.14■■■□□ 2.58
PTPRU-206ENST00000465525 SMARCA4P51532 1647 aa31.13■■■□□ 2.57
PTPRU-206ENST00000465525 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
PTPRU-206ENST00000465525 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
PTPRU-206ENST00000465525 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.97■■■□□ 2.55
PTPRU-206ENST00000465525 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.94■■■□□ 2.54
PTPRU-206ENST00000465525 WIZO95785 1651 aa30.89■■■□□ 2.54
PTPRU-206ENST00000465525 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.81■■■□□ 2.52
PTPRU-206ENST00000465525 SMARCA2P51531 1590 aa30.79■■■□□ 2.52
PTPRU-206ENST00000465525 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.79■■■□□ 2.52
PTPRU-206ENST00000465525 NCAPD3P42695 1498 aa30.72■■■□□ 2.51
PTPRU-206ENST00000465525 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
PTPRU-206ENST00000465525 HMGXB3Q12766 1538 aa30.58■■■□□ 2.49
PTPRU-206ENST00000465525 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
PTPRU-206ENST00000465525 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.17■■■□□ 2.42
PTPRU-206ENST00000465525 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.87■■■□□ 2.37
PTPRU-206ENST00000465525 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.79■■■□□ 2.36
PTPRU-206ENST00000465525 CFTRP13569 1480 aa29.79■■■□□ 2.36
PTPRU-206ENST00000465525 NESP48681 1621 aa29.78■■■□□ 2.36
PTPRU-206ENST00000465525 PRDM2Q13029 1718 aa29.62■■■□□ 2.33
PTPRU-206ENST00000465525 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRU-206ENST00000465525 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.5■■■□□ 2.31
PTPRU-206ENST00000465525 ERCC6Q03468 1493 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRU-206ENST00000465525 ABCC8Q09428 1581 aa29.42■■■□□ 2.3
PTPRU-206ENST00000465525 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.41■■■□□ 2.3
PTPRU-206ENST00000465525 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.4■■■□□ 2.3
PTPRU-206ENST00000465525 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.29■■■□□ 2.28
PTPRU-206ENST00000465525 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.23■■■□□ 2.27
PTPRU-206ENST00000465525 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.22■■■□□ 2.27
PTPRU-206ENST00000465525 SYNJ1O43426 1573 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPRU-206ENST00000465525 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
PTPRU-206ENST00000465525 CUX1P39880 1505 aa29.15■■■□□ 2.26
PTPRU-206ENST00000465525 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
PTPRU-206ENST00000465525 TRIM41Q8WV44 630 aa29.12■■■□□ 2.25
PTPRU-206ENST00000465525 WDR62O43379 1518 aa29.1■■■□□ 2.25
PTPRU-206ENST00000465525 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.08■■■□□ 2.25
PTPRU-206ENST00000465525 TOPBP1Q92547 1522 aa29.08■■■□□ 2.25
PTPRU-206ENST00000465525 TOP2BQ02880 1626 aa29.07■■■□□ 2.24
PTPRU-206ENST00000465525 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.07■■■□□ 2.24
PTPRU-206ENST00000465525 CUX2O14529 1486 aa28.94■■■□□ 2.22
PTPRU-206ENST00000465525 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRU-206ENST00000465525 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
PTPRU-206ENST00000465525 SOGA1O94964 1423 aa28.81■■■□□ 2.2
PTPRU-206ENST00000465525 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.78■■■□□ 2.2
PTPRU-206ENST00000465525 IFT140Q96RY7 1462 aa28.77■■■□□ 2.2
PTPRU-206ENST00000465525 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
PTPRU-206ENST00000465525 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.65■■■□□ 2.18
PTPRU-206ENST00000465525 WDR97A6NE52 1622 aa28.65■■■□□ 2.18
PTPRU-206ENST00000465525 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRU-206ENST00000465525 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
PTPRU-206ENST00000465525 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PTPRU-206ENST00000465525 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.166e-7■■■■■ 27.8
PTPRU-206ENST00000465525 KIF27Q86VH2 1401 aa28.51■■■□□ 2.15
PTPRU-206ENST00000465525 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.48■■■□□ 2.15
PTPRU-206ENST00000465525 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.46■■■□□ 2.15
PTPRU-206ENST00000465525 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PTPRU-206ENST00000465525 EEA1Q15075 1411 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRU-206ENST00000465525 PBRM1Q86U86 1689 aa28.39■■■□□ 2.13
PTPRU-206ENST00000465525 GRIN2BQ13224 1484 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRU-206ENST00000465525 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRU-206ENST00000465525 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRU-206ENST00000465525 IGF1RP08069 1367 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRU-206ENST00000465525 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRU-206ENST00000465525 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRU-206ENST00000465525 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
PTPRU-206ENST00000465525 CUL7Q14999 1698 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRU-206ENST00000465525 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.2■■■□□ 2.11
PTPRU-206ENST00000465525 KIF21BO75037 1637 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRU-206ENST00000465525 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRU-206ENST00000465525 PRXQ9BXM0 1461 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRU-206ENST00000465525 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRU-206ENST00000465525 ADAMTS12P58397 1594 aa28.15■■■□□ 2.1
PTPRU-206ENST00000465525 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.14■■■□□ 2.09
PTPRU-206ENST00000465525 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
PTPRU-206ENST00000465525 SYNJ2O15056 1496 aa28.12■■■□□ 2.09
PTPRU-206ENST00000465525 FBLN2P98095 1184 aa28.11■■■□□ 2.09
PTPRU-206ENST00000465525 GOLGA3Q08378 1498 aa28.07■■■□□ 2.08
PTPRU-206ENST00000465525 GRIN2AQ12879 1464 aa28■■■□□ 2.07
PTPRU-206ENST00000465525 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
PTPRU-206ENST00000465525 CHD1O14646 1710 aa27.98■■■□□ 2.07
PTPRU-206ENST00000465525 OSCARQ8IYS5 282 aa27.92■■■□□ 2.06
PTPRU-206ENST00000465525 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.87■■■□□ 2.05
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