RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564940.2

CHTF18-215, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 197 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-215ENST00000564940 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.16■■■■■ 4.18
CHTF18-215ENST00000564940 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.86■■■■□ 3.49
CHTF18-215ENST00000564940 ABCC9O60706 1549 aa36.72■■■■□ 3.47
CHTF18-215ENST00000564940 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35■■■■□ 3.19
CHTF18-215ENST00000564940 NACADO15069 1562 aa34.8■■■■□ 3.16
CHTF18-215ENST00000564940 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.61■■■■□ 3.13
CHTF18-215ENST00000564940 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.39■■■■□ 3.1
CHTF18-215ENST00000564940 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.36■■■■□ 3.09
CHTF18-215ENST00000564940 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.27■■■■□ 3.08
CHTF18-215ENST00000564940 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.21■■■■□ 3.07
CHTF18-215ENST00000564940 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
CHTF18-215ENST00000564940 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.04■■■■□ 3.04
CHTF18-215ENST00000564940 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.01■■■■□ 3.04
CHTF18-215ENST00000564940 SCRIBQ14160 1630 aa33.61■■■□□ 2.97
CHTF18-215ENST00000564940 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.54■■■□□ 2.96
CHTF18-215ENST00000564940 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.19■■■□□ 2.9
CHTF18-215ENST00000564940 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
CHTF18-215ENST00000564940 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.05■■■□□ 2.88
CHTF18-215ENST00000564940 NCAPD3P42695 1498 aa32.15■■■□□ 2.74
CHTF18-215ENST00000564940 SMARCA4P51532 1647 aa32.08■■■□□ 2.73
CHTF18-215ENST00000564940 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.07■■■□□ 2.72
CHTF18-215ENST00000564940 SMARCA2P51531 1590 aa31.96■■■□□ 2.71
CHTF18-215ENST00000564940 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
CHTF18-215ENST00000564940 HMGXB3Q12766 1538 aa31.91■■■□□ 2.7
CHTF18-215ENST00000564940 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.78■■■□□ 2.68
CHTF18-215ENST00000564940 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.74■■■□□ 2.67
CHTF18-215ENST00000564940 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
CHTF18-215ENST00000564940 ERCC6Q03468 1493 aa31.65■■■□□ 2.66
CHTF18-215ENST00000564940 NESP48681 1621 aa31.61■■■□□ 2.65
CHTF18-215ENST00000564940 CUX2O14529 1486 aa31.56■■■□□ 2.64
CHTF18-215ENST00000564940 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.39■■■□□ 2.62
CHTF18-215ENST00000564940 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.39■■■□□ 2.61
CHTF18-215ENST00000564940 WIZO95785 1651 aa31.36■■■□□ 2.61
CHTF18-215ENST00000564940 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.6
CHTF18-215ENST00000564940 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.21■■■□□ 2.59
CHTF18-215ENST00000564940 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.16■■■□□ 2.58
CHTF18-215ENST00000564940 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.16■■■□□ 2.58
CHTF18-215ENST00000564940 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CHTF18-215ENST00000564940 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
CHTF18-215ENST00000564940 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.91■■■□□ 2.54
CHTF18-215ENST00000564940 CFTRP13569 1480 aa30.86■■■□□ 2.53
CHTF18-215ENST00000564940 WDR62O43379 1518 aa30.86■■■□□ 2.53
CHTF18-215ENST00000564940 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.82■■■□□ 2.52
CHTF18-215ENST00000564940 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.81■■■□□ 2.52
CHTF18-215ENST00000564940 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.61■■■□□ 2.49
CHTF18-215ENST00000564940 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.49
CHTF18-215ENST00000564940 PRDM2Q13029 1718 aa30.56■■■□□ 2.48
CHTF18-215ENST00000564940 TOPBP1Q92547 1522 aa30.25■■■□□ 2.43
CHTF18-215ENST00000564940 IFT140Q96RY7 1462 aa30.19■■■□□ 2.42
CHTF18-215ENST00000564940 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
CHTF18-215ENST00000564940 ABCC8Q09428 1581 aa30.15■■■□□ 2.42
CHTF18-215ENST00000564940 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.15■■■□□ 2.42
CHTF18-215ENST00000564940 OSCARQ8IYS5 282 aa30.13■■■□□ 2.41
CHTF18-215ENST00000564940 TRIM41Q8WV44 630 aa30.04■■■□□ 2.4
CHTF18-215ENST00000564940 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CHTF18-215ENST00000564940 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CHTF18-215ENST00000564940 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CHTF18-215ENST00000564940 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.91■■■□□ 2.38
CHTF18-215ENST00000564940 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.85■■■□□ 2.37
CHTF18-215ENST00000564940 CUX1P39880 1505 aa29.81■■■□□ 2.36
CHTF18-215ENST00000564940 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
CHTF18-215ENST00000564940 SOGA1O94964 1423 aa29.79■■■□□ 2.36
CHTF18-215ENST00000564940 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.79■■■□□ 2.36
CHTF18-215ENST00000564940 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.77■■■□□ 2.36
CHTF18-215ENST00000564940 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.77■■■□□ 2.36
CHTF18-215ENST00000564940 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.77■■■□□ 2.36
CHTF18-215ENST00000564940 CHD1O14646 1710 aa29.76■■■□□ 2.35
CHTF18-215ENST00000564940 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CHTF18-215ENST00000564940 ARHGEF11O15085 1522 aa29.69■■■□□ 2.34
CHTF18-215ENST00000564940 WDR97A6NE52 1622 aa29.66■■■□□ 2.34
CHTF18-215ENST00000564940 FBLN2P98095 1184 aa29.62■■■□□ 2.33
CHTF18-215ENST00000564940 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.59■■■□□ 2.33
CHTF18-215ENST00000564940 GRIN2BQ13224 1484 aa29.52■■■□□ 2.32
CHTF18-215ENST00000564940 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
CHTF18-215ENST00000564940 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.45■■■□□ 2.31
CHTF18-215ENST00000564940 PBRM1Q86U86 1689 aa29.44■■■□□ 2.3
CHTF18-215ENST00000564940 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.44■■■□□ 2.3
CHTF18-215ENST00000564940 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.43■■■□□ 2.3
CHTF18-215ENST00000564940 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
CHTF18-215ENST00000564940 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.43■■■□□ 2.3
CHTF18-215ENST00000564940 SYNJ2O15056 1496 aa29.42■■■□□ 2.3
CHTF18-215ENST00000564940 ARAP1Q96P48 1450 aa29.42■■■□□ 2.3
CHTF18-215ENST00000564940 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.42■■■□□ 2.3
CHTF18-215ENST00000564940 SYNJ1O43426 1573 aa29.37■■■□□ 2.29
CHTF18-215ENST00000564940 TOP2BQ02880 1626 aa29.36■■■□□ 2.29
CHTF18-215ENST00000564940 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.36■■■□□ 2.29
CHTF18-215ENST00000564940 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.34■■■□□ 2.29
CHTF18-215ENST00000564940 ADAMTS12P58397 1594 aa29.18■■■□□ 2.26
CHTF18-215ENST00000564940 GRIN2AQ12879 1464 aa29.16■■■□□ 2.26
CHTF18-215ENST00000564940 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.08■■■□□ 2.25
CHTF18-215ENST00000564940 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.07■■■□□ 2.24
CHTF18-215ENST00000564940 NUP160Q12769 1436 aa29.07■■■□□ 2.24
CHTF18-215ENST00000564940 CEP170Q5SW79 1584 aa29.07■■■□□ 2.24
CHTF18-215ENST00000564940 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
CHTF18-215ENST00000564940 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29■■■□□ 2.23
CHTF18-215ENST00000564940 SHROOM2Q13796 1616 aa28.94■■■□□ 2.22
CHTF18-215ENST00000564940 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.77■■■□□ 2.2
CHTF18-215ENST00000564940 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
CHTF18-215ENST00000564940 IGF1RP08069 1367 aa28.75■■■□□ 2.19
CHTF18-215ENST00000564940 KIF27Q86VH2 1401 aa28.75■■■□□ 2.19
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