Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBX1Q14549 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
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GBX1Q14549 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBX1Q14549 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
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