Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2H2Q13888 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2H2Q13888 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H2Q13888 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms