Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CUL4AQ13619 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CUL4AQ13619 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CUL4AQ13619 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
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