Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BFSP2Q13515 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BFSP2Q13515 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BFSP2Q13515 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BFSP2Q13515 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BFSP2Q13515 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BFSP2Q13515 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
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