Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CHAF1AQ13111 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CHAF1AQ13111 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHAF1AQ13111 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
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