Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP1B1Q10567 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP1B1Q10567 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1B1Q10567 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1B1Q10567 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms