Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM27E3Q08E93 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM27E3Q08E93 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM27E3Q08E93 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms