Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3AQ05086 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3AQ05086 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE3AQ05086 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms