Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLOD1Q02809 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLOD1Q02809 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLOD1Q02809 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms