Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAP1Q01518 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAP1Q01518 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CAP1Q01518 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAP1Q01518 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms