Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSG4Q00888 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSG4Q00888 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSG4Q00888 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms