Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HSF1Q00613 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSF1Q00613 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSF1Q00613 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HSF1Q00613 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms