Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5Q00535 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK5Q00535 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms