Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ELF3P78545 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ELF3P78545 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ELF3P78545 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ELF3P78545 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ELF3P78545 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ELF3P78545 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ELF3P78545 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ELF3P78545 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ELF3P78545 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ELF3P78545 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ELF3P78545 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ELF3P78545 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ELF3P78545 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ELF3P78545 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ELF3P78545 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELF3P78545 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELF3P78545 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELF3P78545 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELF3P78545 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELF3P78545 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELF3P78545 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELF3P78545 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELF3P78545 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELF3P78545 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELF3P78545 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELF3P78545 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELF3P78545 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELF3P78545 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELF3P78545 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELF3P78545 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELF3P78545 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELF3P78545 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELF3P78545 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ELF3P78545 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELF3P78545 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELF3P78545 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELF3P78545 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELF3P78545 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELF3P78545 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELF3P78545 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELF3P78545 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELF3P78545 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELF3P78545 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ELF3P78545 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELF3P78545 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF3P78545 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF3P78545 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF3P78545 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF3P78545 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF3P78545 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF3P78545 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF3P78545 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF3P78545 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF3P78545 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF3P78545 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF3P78545 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF3P78545 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELF3P78545 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ELF3P78545 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELF3P78545 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELF3P78545 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELF3P78545 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELF3P78545 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELF3P78545 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELF3P78545 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELF3P78545 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELF3P78545 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELF3P78545 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELF3P78545 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELF3P78545 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELF3P78545 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ELF3P78545 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ELF3P78545 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ELF3P78545 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELF3P78545 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELF3P78545 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELF3P78545 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELF3P78545 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELF3P78545 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELF3P78545 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELF3P78545 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELF3P78545 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELF3P78545 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELF3P78545 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELF3P78545 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ELF3P78545 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ELF3P78545 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ELF3P78545 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ELF3P78545 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ELF3P78545 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ELF3P78545 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ELF3P78545 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ELF3P78545 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ELF3P78545 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ELF3P78545 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ELF3P78545 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ELF3P78545 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ELF3P78545 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ELF3P78545 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms