Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVK-24P63145 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVK-24P63145 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERVK-24P63145 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms