Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2FP61218 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2FP61218 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms