Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABARAPL2P60520 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPL2P60520 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPL2P60520 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms