Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CHMP4BP1P59074 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHMP4BP1P59074 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP4BP1P59074 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms