Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH11P55287 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH11P55287 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH11P55287 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH11P55287 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH11P55287 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH11P55287 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH11P55287 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH11P55287 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH11P55287 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH11P55287 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH11P55287 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH11P55287 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH11P55287 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH11P55287 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH11P55287 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH11P55287 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH11P55287 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH11P55287 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH11P55287 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH11P55287 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH11P55287 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH11P55287 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH11P55287 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH11P55287 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH11P55287 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH11P55287 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH11P55287 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH11P55287 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH11P55287 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH11P55287 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH11P55287 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH11P55287 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH11P55287 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH11P55287 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH11P55287 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH11P55287 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH11P55287 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH11P55287 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH11P55287 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH11P55287 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH11P55287 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH11P55287 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH11P55287 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH11P55287 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH11P55287 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH11P55287 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH11P55287 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH11P55287 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH11P55287 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH11P55287 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH11P55287 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH11P55287 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH11P55287 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH11P55287 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH11P55287 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH11P55287 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH11P55287 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH11P55287 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH11P55287 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH11P55287 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH11P55287 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH11P55287 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH11P55287 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH11P55287 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH11P55287 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH11P55287 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH11P55287 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH11P55287 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH11P55287 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH11P55287 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH11P55287 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH11P55287 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH11P55287 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH11P55287 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH11P55287 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH11P55287 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH11P55287 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH11P55287 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH11P55287 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH11P55287 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH11P55287 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH11P55287 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH11P55287 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH11P55287 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms