Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP3M2P53677 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
AP3M2P53677 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP3M2P53677 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
AP3M2P53677 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AP3M2P53677 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.2 ms