Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPB1P53618 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPB1P53618 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPB1P53618 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPB1P53618 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPB1P53618 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPB1P53618 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPB1P53618 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB1P53618 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB1P53618 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB1P53618 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB1P53618 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB1P53618 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB1P53618 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB1P53618 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB1P53618 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB1P53618 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPB1P53618 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPB1P53618 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPB1P53618 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPB1P53618 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPB1P53618 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPB1P53618 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPB1P53618 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPB1P53618 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPB1P53618 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPB1P53618 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPB1P53618 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPB1P53618 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPB1P53618 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COPB1P53618 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COPB1P53618 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COPB1P53618 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COPB1P53618 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPB1P53618 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPB1P53618 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPB1P53618 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPB1P53618 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPB1P53618 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPB1P53618 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPB1P53618 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPB1P53618 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPB1P53618 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPB1P53618 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPB1P53618 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPB1P53618 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPB1P53618 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPB1P53618 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPB1P53618 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPB1P53618 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPB1P53618 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPB1P53618 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPB1P53618 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPB1P53618 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COPB1P53618 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COPB1P53618 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COPB1P53618 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COPB1P53618 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COPB1P53618 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPB1P53618 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPB1P53618 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPB1P53618 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPB1P53618 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPB1P53618 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPB1P53618 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPB1P53618 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPB1P53618 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPB1P53618 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPB1P53618 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPB1P53618 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB1P53618 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB1P53618 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB1P53618 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB1P53618 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB1P53618 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB1P53618 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB1P53618 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB1P53618 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB1P53618 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COPB1P53618 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COPB1P53618 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COPB1P53618 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COPB1P53618 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COPB1P53618 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COPB1P53618 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COPB1P53618 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COPB1P53618 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COPB1P53618 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COPB1P53618 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPB1P53618 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPB1P53618 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPB1P53618 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPB1P53618 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPB1P53618 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPB1P53618 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPB1P53618 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPB1P53618 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPB1P53618 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPB1P53618 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
COPB1P53618 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms