Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KPNA2P52292 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KPNA2P52292 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KPNA2P52292 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms