Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCLCP48506 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GCLCP48506 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GCLCP48506 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GCLCP48506 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GCLCP48506 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GCLCP48506 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GCLCP48506 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GCLCP48506 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GCLCP48506 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GCLCP48506 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GCLCP48506 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GCLCP48506 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GCLCP48506 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GCLCP48506 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCLCP48506 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCLCP48506 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GCLCP48506 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCLCP48506 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GCLCP48506 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCLCP48506 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCLCP48506 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCLCP48506 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GCLCP48506 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GCLCP48506 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCLCP48506 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCLCP48506 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCLCP48506 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GCLCP48506 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCLCP48506 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCLCP48506 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCLCP48506 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCLCP48506 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCLCP48506 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCLCP48506 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GCLCP48506 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCLCP48506 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCLCP48506 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCLCP48506 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCLCP48506 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GCLCP48506 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCLCP48506 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCLCP48506 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCLCP48506 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCLCP48506 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCLCP48506 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCLCP48506 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCLCP48506 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GCLCP48506 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCLCP48506 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCLCP48506 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCLCP48506 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCLCP48506 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCLCP48506 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCLCP48506 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCLCP48506 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCLCP48506 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCLCP48506 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCLCP48506 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCLCP48506 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GCLCP48506 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCLCP48506 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCLCP48506 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCLCP48506 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCLCP48506 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCLCP48506 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCLCP48506 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GCLCP48506 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCLCP48506 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCLCP48506 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GCLCP48506 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCLCP48506 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GCLCP48506 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCLCP48506 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCLCP48506 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCLCP48506 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCLCP48506 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GCLCP48506 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GCLCP48506 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GCLCP48506 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCLCP48506 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCLCP48506 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCLCP48506 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCLCP48506 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCLCP48506 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCLCP48506 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCLCP48506 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCLCP48506 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCLCP48506 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCLCP48506 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCLCP48506 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCLCP48506 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCLCP48506 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GCLCP48506 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GCLCP48506 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCLCP48506 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCLCP48506 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCLCP48506 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCLCP48506 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCLCP48506 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms