Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LSSP48449 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSSP48449 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSSP48449 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSSP48449 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LSSP48449 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSSP48449 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSSP48449 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSSP48449 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSSP48449 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSSP48449 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSSP48449 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSSP48449 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LSSP48449 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSSP48449 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSSP48449 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSSP48449 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSSP48449 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSSP48449 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSSP48449 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSSP48449 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSSP48449 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSSP48449 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSSP48449 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSSP48449 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSSP48449 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSSP48449 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSSP48449 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSSP48449 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LSSP48449 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LSSP48449 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSSP48449 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSSP48449 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSSP48449 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSSP48449 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSSP48449 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSSP48449 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSSP48449 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LSSP48449 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSSP48449 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSSP48449 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSSP48449 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSSP48449 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSSP48449 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSSP48449 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSSP48449 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LSSP48449 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSSP48449 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LSSP48449 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LSSP48449 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSSP48449 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSSP48449 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSSP48449 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSSP48449 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSSP48449 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSSP48449 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSSP48449 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSSP48449 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSSP48449 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSSP48449 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSSP48449 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSSP48449 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSSP48449 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LSSP48449 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSSP48449 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSSP48449 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LSSP48449 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LSSP48449 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSSP48449 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LSSP48449 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSSP48449 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSSP48449 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSSP48449 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSSP48449 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSSP48449 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSSP48449 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSSP48449 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSSP48449 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSSP48449 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSSP48449 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LSSP48449 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSSP48449 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSSP48449 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSSP48449 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSSP48449 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSSP48449 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSSP48449 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSSP48449 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSSP48449 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSSP48449 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSSP48449 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSSP48449 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSSP48449 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSSP48449 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSSP48449 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSSP48449 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSSP48449 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSSP48449 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSSP48449 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSSP48449 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms