Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REG1BP48304 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REG1BP48304 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REG1BP48304 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REG1BP48304 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REG1BP48304 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
REG1BP48304 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REG1BP48304 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REG1BP48304 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REG1BP48304 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REG1BP48304 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REG1BP48304 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
REG1BP48304 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REG1BP48304 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REG1BP48304 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REG1BP48304 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REG1BP48304 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REG1BP48304 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REG1BP48304 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REG1BP48304 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
REG1BP48304 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REG1BP48304 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REG1BP48304 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REG1BP48304 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REG1BP48304 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REG1BP48304 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REG1BP48304 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REG1BP48304 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REG1BP48304 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REG1BP48304 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REG1BP48304 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
REG1BP48304 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REG1BP48304 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REG1BP48304 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REG1BP48304 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REG1BP48304 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REG1BP48304 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REG1BP48304 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REG1BP48304 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REG1BP48304 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REG1BP48304 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REG1BP48304 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
REG1BP48304 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REG1BP48304 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REG1BP48304 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REG1BP48304 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REG1BP48304 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REG1BP48304 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REG1BP48304 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REG1BP48304 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REG1BP48304 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REG1BP48304 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REG1BP48304 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REG1BP48304 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REG1BP48304 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REG1BP48304 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
REG1BP48304 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REG1BP48304 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REG1BP48304 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REG1BP48304 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REG1BP48304 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REG1BP48304 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REG1BP48304 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REG1BP48304 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
REG1BP48304 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REG1BP48304 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
REG1BP48304 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REG1BP48304 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REG1BP48304 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REG1BP48304 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REG1BP48304 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REG1BP48304 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REG1BP48304 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REG1BP48304 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REG1BP48304 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
REG1BP48304 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REG1BP48304 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REG1BP48304 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REG1BP48304 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REG1BP48304 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REG1BP48304 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
REG1BP48304 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REG1BP48304 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
REG1BP48304 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
REG1BP48304 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
REG1BP48304 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
REG1BP48304 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
REG1BP48304 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
REG1BP48304 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
REG1BP48304 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REG1BP48304 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REG1BP48304 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REG1BP48304 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REG1BP48304 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REG1BP48304 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REG1BP48304 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
REG1BP48304 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REG1BP48304 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REG1BP48304 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REG1BP48304 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms