Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYLC1P35663 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CYLC1P35663 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYLC1P35663 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CYLC1P35663 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CYLC1P35663 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYLC1P35663 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYLC1P35663 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYLC1P35663 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYLC1P35663 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYLC1P35663 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYLC1P35663 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYLC1P35663 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYLC1P35663 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYLC1P35663 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CYLC1P35663 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYLC1P35663 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYLC1P35663 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYLC1P35663 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms