Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCKBRP32239 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCKBRP32239 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCKBRP32239 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms