Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SSFA2P28290 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SSFA2P28290 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SSFA2P28290 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms