Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RXRAP19793 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RXRAP19793 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RXRAP19793 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RXRAP19793 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RXRAP19793 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RXRAP19793 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RXRAP19793 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RXRAP19793 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RXRAP19793 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RXRAP19793 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RXRAP19793 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RXRAP19793 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RXRAP19793 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RXRAP19793 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RXRAP19793 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RXRAP19793 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RXRAP19793 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RXRAP19793 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RXRAP19793 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RXRAP19793 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RXRAP19793 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RXRAP19793 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RXRAP19793 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RXRAP19793 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RXRAP19793 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RXRAP19793 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RXRAP19793 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RXRAP19793 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RXRAP19793 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RXRAP19793 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RXRAP19793 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RXRAP19793 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RXRAP19793 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RXRAP19793 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RXRAP19793 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RXRAP19793 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RXRAP19793 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RXRAP19793 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RXRAP19793 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RXRAP19793 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RXRAP19793 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RXRAP19793 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RXRAP19793 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RXRAP19793 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RXRAP19793 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RXRAP19793 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RXRAP19793 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRAP19793 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRAP19793 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRAP19793 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRAP19793 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRAP19793 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRAP19793 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RXRAP19793 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RXRAP19793 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RXRAP19793 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRAP19793 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRAP19793 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRAP19793 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRAP19793 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRAP19793 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RXRAP19793 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRAP19793 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRAP19793 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RXRAP19793 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RXRAP19793 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RXRAP19793 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRAP19793 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRAP19793 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRAP19793 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RXRAP19793 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RXRAP19793 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RXRAP19793 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RXRAP19793 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RXRAP19793 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RXRAP19793 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RXRAP19793 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RXRAP19793 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RXRAP19793 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RXRAP19793 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RXRAP19793 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RXRAP19793 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RXRAP19793 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RXRAP19793 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RXRAP19793 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RXRAP19793 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RXRAP19793 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RXRAP19793 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RXRAP19793 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RXRAP19793 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RXRAP19793 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RXRAP19793 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RXRAP19793 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RXRAP19793 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRAP19793 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRAP19793 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRAP19793 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRAP19793 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXRAP19793 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms