Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDCP19113 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDCP19113 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDCP19113 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDCP19113 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDCP19113 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HDCP19113 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HDCP19113 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDCP19113 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDCP19113 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDCP19113 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDCP19113 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDCP19113 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDCP19113 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDCP19113 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDCP19113 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDCP19113 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDCP19113 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDCP19113 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDCP19113 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDCP19113 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDCP19113 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDCP19113 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDCP19113 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDCP19113 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDCP19113 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDCP19113 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDCP19113 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HDCP19113 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HDCP19113 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDCP19113 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HDCP19113 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDCP19113 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDCP19113 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDCP19113 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDCP19113 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDCP19113 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDCP19113 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HDCP19113 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDCP19113 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDCP19113 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HDCP19113 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HDCP19113 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HDCP19113 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDCP19113 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HDCP19113 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDCP19113 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDCP19113 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDCP19113 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDCP19113 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDCP19113 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDCP19113 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDCP19113 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HDCP19113 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDCP19113 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDCP19113 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDCP19113 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDCP19113 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDCP19113 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDCP19113 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDCP19113 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDCP19113 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HDCP19113 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HDCP19113 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDCP19113 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDCP19113 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDCP19113 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDCP19113 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDCP19113 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDCP19113 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HDCP19113 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDCP19113 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDCP19113 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDCP19113 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDCP19113 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HDCP19113 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDCP19113 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDCP19113 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDCP19113 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDCP19113 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDCP19113 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDCP19113 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDCP19113 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDCP19113 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDCP19113 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDCP19113 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDCP19113 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDCP19113 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDCP19113 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDCP19113 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDCP19113 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDCP19113 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDCP19113 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDCP19113 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDCP19113 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDCP19113 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDCP19113 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDCP19113 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HDCP19113 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDCP19113 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms