Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN1P18031 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN1P18031 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPN1P18031 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN1P18031 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN1P18031 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms